ماده 13- ماليات و عوارض ارزش افزوده نفت توليدي و فرآورده هاي نفتي وارداتي و توليدي و همچنين ماليات و عوارض ارزش افزوده گاز مندرج در صورت حساب (قبوض) مصرف كنندگان فقط يكبار در انتهاي زنجيره توليد، انتقال، توزيع و فروش آنها توسط شركت پالايش پخش / شركت هاي پالايش نفت و شركت هاي گاز استاني بر مبناي قيمت فروش داخلي محاسبه و دريافت مي شود و حسب مورد توسط شركت هاي فوق الذكر / شركت ملي گاز ايران به حساب سازمان امور مالياتي كشور نزد خزانه پرداخت مي گردد.
بدين ترتيب شركت هاي موجود در زنجيره مكلف به انجام تكاليف مقرر در قانون ماليات بر ارزش افزوده از جمله صدور صورتحساب فروش، محاسبه و درج ماليات و عوارض ارزش افزوده فروش كالا و خدمات مشمول در صورتحساب، اخذ ماليات و عوارض ارزش افزوده فروش كالا و خدمات مشمول (به استثناي دريافت و پرداخت ماليات و عوارض ارزش افزوده فروش كالا و خدمات فوق الذكر حسب مورد في مابين شركت هاي فعال در زنجيره مشمول حكم ياد شده) مي باشند. ماليات و عوارض ارزش افزوده هر حلقه به حلقه بعد منتقل و به عنوان اعتبار حلقه بعد با رعايت قانون ماليات بر ارزش افزوده قابل قبول خواهد بود. در تعيين ماليات بر ارزش افزوده هر حلقه ماليات و عوارض پرداختي بابت خريد كالا و خدمات برابر مقررات قابل پذيرش مي باشد.
ماليات و عوارض ارزش افزوده وصول شده در حلقه آخر با توجه به سهم ماليات و عوارض ارزش افزوده هر كدام از شركت هاي حاضر در زنجيره به عنوان ماليات و عوارض حلقه هاي قبلي قابل تخصيص خواهد بود. در صورت عدم واريز ماليات و عوارض ارزش افزوده توسط اشخاص حلقه آخر فوق الذكر طبق حكم ماده (4) قانون الحاق برخي مواد به قانون تنظيم بخشي از مقررات مالي دولت (2)، خزانه داري كل كشور مكلف است بر اساس اعلام سازمان امور مالياتي كشور از موجودي حساب آنها نزد خزانه داري كل كشور برداشت و به حساب هاي تعيين شده سازمان مذكور نزد خزانه واريز نمايد. فهرست اشخاص قبل و انتهاي زنجيره توليد، انتقال، توزيع و فروش از جمله شركت ملي نفت ايران به تفكيك توسط وزارت نفت به سازمان امور مالياتي كشور اعلام مي گردد.
تبصره 1(اصلاحي 04ˏ07ˏ1397)- نفت خام، ميعانات گازي و گاز غني خريداري شده از دولت توسط شركت ملي نفت ايران و همچنين فروش داخلي آنها به شركت هاي موجود در زنجيره و صادرات آن، مستلزم محاسبه و دريافت ماليات و عوارض ارزش افزوده از حلقه بعدي نيست. ماليات و عوارض ارزش افزوده مربوط به فروش ساير كالاها و خدمات توسط شركت ملي نفت ايران و اعتبار مالياتي مربوط كالاها و خدمات ياد شده، مطابق قانون ماليات بر ارزش افزوده - مصوب 1387- قابل پذيرش، محاسبه و دريافت است.
تبصره 2(اصلاحي 04ˏ07ˏ1397)- سازمان امور مالياتي كشور با رعايت حكم اين ماده و تبصره (1) آن، در مورد ماليات بر ارزش افزوده شركت ملي نفت ايران اقدام مي كند.